Le manuel de référence suivant concernant le logiciel du système Silent Cube s'adresse en premier lieu aux utilisateurs ou administrateurs expérimentés sur le plan technique et présente toutes les fonctions de la Silent Cubes Software.
La Silent Cubes Software organise l'ensemble de ses fonctions au sein des trois menus Volumes & partages, Paramètres et État du système. Cette Partie C du manuel traite ces menus de manière hiérarchique, « de haut en bas », afin qu'une fonction puisse être recherchée le plus simplement possible.
Les chapitres Gestion du stockage des Silent Cubes et Silent Cubes Software permettent d'acquérir une compréhension de base et de savoir utiliser le système.